Muziejaus biblioteka kuriama atsižvelgiant
į šimtametę Varnių kunigų seminarijos bibliotekos istoriją bei
Varnių, knygos miesto, tradicijas. Muziejaus bibliotekoje jau
sukaupta daugiau negu 4060 egzempliorių spaudinių, suskirstytų į
retuosius spaudinius, išspausdintus iki 1945 m., ir šiuolaikinę
literatūrą.
Retųjų spaudinių kolekciją sudaro
daugiausia religinė literatūra ir spauda. Seniausias spaudinys
išleistas 1826 m. ir paženklintas ovaliu antspaudu su tekstu „Bibliotheca
Alumnorum Seminarii Samogitiensis“. Spėjame, kad ši ir dar 15
knygų, paženklintų tuo pačiu antspaudu ir tekstu, priklausė
buvusiai Varnių kunigų seminarijai ir buvo naudojamos jos
auklėtinių. Šias knygas muziejui perdavė Nacionalinė M. Mažvydo
biblioteka. Vienas vertingiausių turimų retųjų spaudinių yra
1859-1868 m. išleista „Encyklopedyja powszechna“ T. XXVIII.
Fonduose yra vysk. M.
Valančiaus,
J. I. Kraszewskio, Vydūno, Žemaitės, kun. A. Aleknos ir
daugelio kitų iškilių autorių veikalų.
Bibliotekoje sukaupta nemažai
komplektų periodinės spaudos, leistos tarpukario Lietuvoje: „Kultūra”,
„Židinys”, „Lietuvos Mokykla”, „Tiesos Kelias”, „Soter”,
V. Krėvės-Mickevičiaus redaguotas mėnesinis literatūros žurnalas
„Skaitymai“.
Kitą bibliotekos dalį sudaro
spaudiniai, išleisti po 1945 m. Jie suskirstyti į skyrius:
informaciniai leidiniai, grožinė, religinė literatūra,
literatūros mokslas, filosofija, dailė, muzika, architektūra,
istorijos mokslas. Tarp jų yra keletas knygų serijų: „Lietuvos
Katalikų Bažnyčios Kronika”, Bostone išleista serija „Krikščionis
gyvenime”, Pasaulinės literatūros biblioteka, Lituanistinė
biblioteka.
Sukaupta daug periodinės spaudos
komplektų: „Lietuvos Aidas”, „Šiaurės Atėnai”, „Tremtinys”,
„Žemaičių saulutė”, „Dienovidis”, „Kultūros barai”,
„Naujasis židinys". Saugomas ir gausus Sąjūdžio laikotarpio
periodinės spaudos rinkinys, kurį Muziejaus bibliotekai perdavė
Pranas B. Vasiliauskas. Prof. Mykolo Giedraičio iš Oksfordo
rūpsečiu, Paryžiaus literatūros instituto „Kultura“ redakcija
muziejui nuolatos siunčia žurnalą „Zeszyty Historyczne“, kur
viename iš numerių rašoma apie žymaus politologo Jurgio
Giedraičio pomirtinę kaukę Varnių katedroje.
Muziejaus bibliotekos fondai nuolat
papildomi. Šiuo metu biblioteka įkurdinta laikinoje patalpoje
(vienoje iš buvusios seminarijos celių). Būsimos muziejaus
biblioteka projektą parengė Vilniaus dailės akademijos Klaipėdos
Vizualinių komunikacijų katedros diplomantė Alma Martinkutė.